江戶川柯南和毛利蘭、灰原哀一起來到了公共浴池。在男浴池的更衣室柯南目擊到2名可疑的男子，隨后，在浴場摔倒失去了意識。于是令柯南感到可疑的男子阿辰和近藤借口將柯南送到醫(yī)院把他用車帶走了。柯南注意到，二人是黑社會中有名的人物，正在浴池執(zhí)行秘密任務。聽說柯南被送往醫(yī)院的小蘭和小哀在附近的醫(yī)院拼命尋找，但并沒有找到他。這時，小蘭的手機收到了“我的傷沒有大礙，不用擔心。我要和認識的大哥哥去吃飯了”的郵件。這封郵件是用柯南所帶的工藤新一的手機發(fā)送的。此時，毛利小五郎的偵探事務所收到了香苗調查丈夫外遇的委托。香苗提供的照片中的前便利店的丈夫，竟然是近藤！香苗對自己的丈夫與黑社會有牽連一事毫不知情。另一方面，在誰都不知道發(fā)號施令的幕后黑手是誰的情況下，近藤依然和同伴們一同執(zhí)行任務。近藤等人的任務是引發(fā)針對某個人物的炸彈襲擊。喪失記憶的柯南被近藤等人利用？！闖空門的專家，天才欺詐師，傳說中的殺手，各種各樣的犯罪者和操縱他們的神秘黑影……各種各樣的人物在案件周圍交錯，案件背后隱藏的真相是……
